生殖器疱疹是误诊率较高的疾病。有好多病人仅仅有一点微薄的包皮龟头炎，即被某些别有入神的所谓医生们诊断为生殖器疱疹，笔者就遇到数位这样的病人。有一些小门诊部受金钱的驱使，时常误导患者。下面推荐几个必要鉴别诊断的疾病。
(1)龟头包皮炎: 初起潮红、糜烂，但些许露出水疱。可有渗液，包皮水肿不能上翻，有时有脓性分泌物。遵守反差的病因可分为外伤性龟头炎、接触性龟头炎、感染性龟头炎、念珠菌性龟头炎、阿米巴性龟头炎、滴虫性龟头炎、浆细胞性龟头炎等
(2)硬下疳: 初步为在传染部位浮现一赤色斑疹或丘疹，经１～２天变为小结而质硬，继而核心糜烂、破溃，呈红铜色，有少许粘性分泌物，呈圆形或随圆形，直径约１厘米，溃疡面整洁，重心*中央稍低陷，周边略高，基底因浸润而硬似软骨，无显眼疼痛，此为典型的硬下疳。硬下疳的分泌物中含大度梅毒螺旋体，传染性强。硬下疳如不治疗，经３～８周可天生消退，通常不留印迹。
(3)软下疳: 隐蔽期通常2～3天，典型下疳初起呈小的炎性丘疹，火速变成脓疱，破溃后造成圆形或卵圆形表浅溃疡，性质蓬松、疼痛显眼，直径约数毫米～2cm，边缘不整井然齐，呈穿凿性，四周有炎性红晕，溃疡底部覆以灰黄色坏死性脓苔和脓性分泌物，易出血。数目首先1～2个，可因亲自接种，四面可出现2～5个成簇的卫星状溃疡。男性好发于阴茎冠状沟、包皮、龟头、肛门。女性好发于大小阴唇、阴唇系带、阴蒂和肛门，亦可出现于子宫颈及尿道内。约有半数病人可出现腹股沟淋迎合炎，男性多见，女性很少显现，以左侧为多，常为单侧性，约为指腹大，表面红肿热痛，有波动，可造成单腔脓肿，易破溃，流出粘稠脓汁称“鱼口”，愈后遗留瘢痕。
(4)淋病: 也可出现龟头包皮炎，但要害表达为急性侵蚀性尿道炎。
(5)康宁红斑性药疹: 随时由于口服磺胺类药物或止痛类药物引起。露出于阴部，有红肿，常破溃，糜烂，也有复发，要担承地盘问病史。